Chelseas Johanna Rytting Kaneryd stod för ett läckert skott i nät där hon tunnlade motståndaren.
Men Amanda Ilestedt fick sista ordet när hon satte det avgörande 2-1-målet för Arsenal som vann med 4-1.
– En dröm att få göra mål på ett nästan helt fullsatt Emirates, säger svenskan till SVT Sport.